组织溯源准确性高达93% | GRAIL公布泛癌早筛最新数据

发布日期:2019-10-22武汉艾米森生命科技有限公司

2019年10月7日,全球最受瞩目的癌症早筛公司GRAIL公布了其通过血液检测实现泛癌早期筛查的最新研究数据,该研究采用的是独立人群队列研究。10月11日至13日在泰国曼谷举行的ASCO突破性会议中,GRAIL就泛癌早期检测试验数据进行了报告,会议摘要Simultaneous multi-cancer detection and tissue of origin (TOO) localization using targeted bisulfite sequencing plasma cell-free DNA (cfDNA)从文末获取。

这一验证性研究的结果表明,GRAIL的检测方法对于20多种癌症类型,能够在所有阶段检测出,且假阳性率非常低。当检测到癌症时,这项检测技术还可以高精度的确定癌症在人体(起源组织)中的位置。在一个预先设定的12种致命癌症(包括肛门癌,膀胱癌,结直肠癌,食道癌,头颈癌,肝/胆管癌,肺癌,淋巴瘤,卵巢癌,胰腺癌,浆细胞瘤和胃癌)类型中,有更高的检出率,而以上12种癌症导致的死亡病例大约占全部癌症死亡病例的三分之二。

GRAIL开展的大规模的临床研究“循环游离基因组图谱研究”(Circulating Cell-free Genome Atlas,CCGA),使用多种策略对受试者血液样本进行分析,旨在开发泛癌早期筛查产品,并通过这个研究验证其性能。本次报告中最新的研究数据,来自于CCGA的第二阶段研究研究,该研究通过评估独立临床试验参与者多种癌症的早期筛查效果,来验证检测性能。验证集的数据表现,与先前报道的用于训练集数据基本一致。

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根据GRAIL公布的信息,该公司的高效甲基化技术能够优先针对基因组信息最丰富的区域,并利用其专有的数据库和机器学习算法来检测癌症的存在并识别肿瘤的组织来源。此外,该公司的癌症及非癌症甲基化特征测序数据库被认为是同类数据库中规模最大的,涵盖了整个基因组中约3000万个甲基化位点,涉及超过20种不同阶段的癌症类型。这也为该公司开发可靠的癌症甲基化分析方法提供了有力的基础。

GRAIL首席执行Hans Bishop表示:“如今,癌症仍然是全球范围内第二大死亡原因,我们相信有效的泛癌早期筛查技术有可能改变癌症防治格局。“我们很高兴能提供这些最新的验证数据,这些数据能够支持我们靶向甲基化技术在临床应用的潜在价值,并加强了我们的市场信心。”

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用于验证GRAIL泛癌早筛检测方法的独立数据集,包括来自CCGA研究的927位参与者(n = 927;其中654癌症患者,273非癌症患者)和STRIVE研究的参与者(n = 337非癌症),涵盖了不同分期的20多种癌症。研究数据显示,在高特异性(99.3%)的情况下,检测敏感性表现优异,并且假阳性率非常低。针对用于大规模人群的无症筛查,较低的假阳性率非常重要,这样可以最大程度地减少不必要的进一步检查和相关的风险。

当特异性为99.3%时,该检测方法对于12种致命癌症类型的总检出率为76%(n = 273/359;95%的置信区间:72-81%),对这组癌症的进一步详细分析,结果显示I-IV期的检测灵敏性分别为39%(27-52%),69%(56-80%),83%(75-90%)和92%(86-96%),其中不同分期的数量分别为I期(n= 62),II期(n = 62),III期(n = 102)和IV期(n = 130)。

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“在泛癌早期筛查产品为患者提供检测服务前,用一组独立的参与者进行性能验证至关重要。” Mayo临床肿瘤学系主任Minetta Liu教授说到,“这项独立验证获得了令人振奋的结果,这也证明了这种检测方法性能稳定。并且该方法可在不同分期阶段检测出20种以上癌症类型,并且假阳性率低,因而可推广到更广泛的人群使用。”

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在20种以上癌症类型中,当特异性为99.3%时,总检出率为55%(n = 361/659;95%置信区间:51-59%),其中I期、II期、III期、IV期的检出率分别为18%(13-25%)、43%(35-51%)、81%(73-87%)和93%(87-96%)。其中各期的数量分别为I期(n = 185),II期(n = 166),第III期(n = 134)IV期(n = 148)。并且在研究中提供了96%(344/359)的组织溯源结果,其中有93%的病例(321/344)可正确识别出原始组织起源。

这项最新研究结果表明,这种检测方法是筛查癌症患者的一种可行方法。GRAIL表示,未来该公司还将陆续发布来自其在研项目的其他新数据。

参考资料:

Minetta Liu, et al. Simultaneous multi-cancer detection and tissue of origin (TOO) localization using targeted bisulfite sequencing plasma cell-free DNA (cfDNA).

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